ESCAPE: Benchmark für antimikrobielle Peptide mit Mehrfachklassifizierung

Forscher haben die erste umfassende, standardisierte Benchmark für die Klassifizierung antimikrobieller Peptide vorgestellt. Das neue ESCAPE‑Set bündelt mehr als 80.000 Peptide aus 27 geprüften Datenbanken und trennt gezielt antimikrobielle Sequenzen von negativen Kontrollen. Durch die Einbettung funktionaler Annotationen in eine biologisch sinnvolle Mehrlabels-Hierarchie deckt ESCAPE Aktivitäten gegen Bakterien, Pilze, Viren und Parasiten ab.

Auf Basis dieses Datensatzes entwickelte ein Team ein transformer‑basiertes Modell, das sowohl sequentielle als auch strukturelle Informationen nutzt, um mehrere Wirkungsprofile gleichzeitig vorherzusagen. Das Verfahren erzielt bis zu 2,56 % höhere mittlere Average Precision im Vergleich zum bisher besten Ansatz und setzt damit einen neuen Standard in der multilabel‑Klassifizierung von Peptiden.

ESCAPE bietet Forschern ein reproduzierbares und transparentes Evaluationsframework, das die Entwicklung von KI‑gestützten Antimicrobial‑Peptide‑Entdeckungen beschleunigt und die Forschung in diesem kritischen Bereich vorantreibt.